新乡医学院档案馆成立于2016年1月，属副处级建制。其前身是学校办公室综合档案室，下设综合科，现有工作人员3名。档案馆现有馆舍建筑面积350平方米，其中档案库房面积250平方米，配备有防磁柜、除湿机、消毒机、加湿器、扫描仪、高拍仪、海康威视监控设施等。

档案馆现馆藏一个全宗，包括党群、行政、教学、科研、基建、仪器设备、产品生产、出版、外事、财会、声像、人物、实物档案等。馆内现有纸质档案9012卷共计17893件。

新乡医学院档案馆认真宣传和实施《中华人民共和国档案法》、《保密法》、《高等学校档案管理办法》、《新乡医学院档案管理办法》和《新乡医学院电子文件归档管理暂行办法》等各项法规制度，不断规范档案的收集、管理和利用，日常主要为师生及社会提供学籍证明材料办理、学历学位认证（学位网学位认证）、校内公务查档、校史馆参观接待等服务。

档案馆坚持贯彻依法治档，规范管档，强化建档，丰富馆藏的指导思想。在学校正阔步迈进高水平医科大学的今天，档案馆将继续贯彻落实科学发展观，围绕学校“十四五”发展规划的宏伟目标，坚持“以服务求生存，以创新求发展”，不断提高档案馆藏数量，不断完善馆藏结构，持续推动档案信息化建设，以更加规范化的档案管理、更加高效便捷的档案查询为学校领导决策、师生及社会服务。