医院管理办公室是在学校党委和行政的直接领导下，对学校附属医院进行管理、服务、协调、监督的职能部门。主要职责如下：
一、组织论证附属医院的整体布局、功能定位、发展方向及其支撑条件，审议附属医院发展的重大决策和重大项目，指导附属医院制定战略规划。
二、协同学校有关部门，对附属医院及其领导班子进行目标管理和绩效考核。
三、审核附属医院需要提交学校会议研究的有关议题。
四、负责附属医院数据信息统计、运行监测分析和专项调研，为附属医院改革发展和学校宏观管理提供决策依据。
五、负责医院管理的理论研究和对外联络工作，组织开展附属医院医政管理干部培训。
六、协同学校有关部门，统筹整合附属医院的医疗、教学和科研资源，推进附属医院的学科整合与重组（建），做好附属医院区域医疗中心、国家重点临床专科（学科）、临床诊疗与研究中心等重点平台的申报与建设工作。
七、协同学校有关部门，推进附属医院医疗数据信息和科研共享平台建设，促进学校基础学科与临床学科的交叉融合与协同创新。
八、配合学校有关部门对附属医院的规划执行情况进行监督考核；配合学校、卫健委及其他部门，指导附属医院做好精神文明建设、行风建设和评优工作，推进附属医院的各项监督、评审和检查工作。
九、组织协调附属医院完成对口支援、援外医疗、医疗救援和保障等任务。
十、完成上级部门和学校交办的其他工作。
